Одно небольшое изменение может вызвать серьезный сдвиг в микробиоме кишечника, что приведет к серьезным последствиям. Когда человек принимает антибиотик, он может уничтожить несколько видов бактерий и разрушить этот тонкий баланс. Clostridioides difficile является распространенным патогеном, который колонизирует нарушенную микробиоту кишечника. Трансплантация фекальной микробиоты (ТФМ) является успешным методом лечения рецидивирующей инфекции C. difficile.
В недавно опубликованном исследовании исследователи из Бригама и Женской больницы исследуют, как динамика видов бактерий может влиять на успех ТФМ в лечении C. difficile. В Nature Communicationsкоманда представляет алгоритм для разработки персонализированных пробиотических коктейлей для пациентов с нездоровыми кишечными микробиомами.»Разработка пробиотического коктейля является сложной задачей», — сказал Ян-Ю Лю, доцент кафедры медицины в Бригаме. — «Все виды в коктейле взаимодействуют в сложной сети. Когда мы смотрим на один вид, который напрямую ингибирует рост C. difficile , мы также должны убедиться, что он не косвенно способствует росту C. difficile через взаимодействия с другими виды в коктейле».
Результаты работы
C. difficile не реагирует на стандартные антибиотики и поэтому может рецидивировать у пациентов, увеличивая риск. Было показано, что Трансплантация фекальной микробиоты излечивает около 80% случаев, которые не реагируют на антибиотики.
Команда разработала алгоритм оптимизации для разработки персонализированного пробиотического коктейля. Алгоритм основан на экологической теории с минимальным количеством видов бактерий сохраняя при этом сложную экологическую сеть видов. Персонализированные пробиотические коктейли содержат виды, которые являются эффективными ингибиторами C. difficile и могут вводиться пациентам с C. difficile для восстановления микробиоты кишечника.
Следите за актуальными новостями о коронавирусе на Медикфорум в режиме онлайн.